公司构建了自主创新、联合育种等多种方式相结合的开放式种业科研创新体系，为公司业务的持续发展提供了产品保障和技术支持。拥有大豆育种站3个、水稻育种站5个、玉米育种站2个，各生态测试点200个，大豆、水稻、玉米新品种53个。年研发投入近700万元，自主研发和联合育成新品种53个，覆盖黑龙江省第 一至第六积温带。在新疆、甘肃、内蒙、佳木斯、北安等地建有高标准制种基地10余个，制种总面积50000亩，年产种子毛粮6万余吨，可满足1500余万亩生产用种。
公司建有生物育种产业创新中 心，该中 心由中国水稻研究所和普田种业共建，占地面积36万平方米，投资1.5亿元，其中生物育种实验楼建筑面积0.23万平方米；仓储加工中 心0.7万平方米；科技示范园区34万平方米，是集创新、展示、转化、产业、资本、服务、孵化多功能于一体的生物农业产业创新综合体。
公司高度重视种质资源保护与利用，于2018年投资建设了种质资源库。现保存种质资源4.4万余份，其中寒地大豆种质资源20000份、寒地水稻种质资源22000份、寒地玉米种质资源2000份。公司在黑龙江省南繁基地、海南省三亚市南滨农场建有育种基地，用于大豆、玉米、水稻的南繁育种加代、种子高倍繁殖和生物育种，加快品种选育进程，提高品种选育质量。
建有商业化育种创新机构，下设水稻、玉米、大豆、农化4个研发分中 心，大豆研发中 心拥有省内领 先的优质种质资源材料，选育出沃豆1号、沃豆2号、沃豆5号、沃豆7、沃豆18、沃豆19、沃豆401、沃豆501等一批优质、高蛋、特用大豆品种，现经营大豆品种21个，其中自主研发16个，国审品种1个，年推广量2.6万吨，推广面积500万亩，服务农户10万余人，垧效益提高1000元以上，沃豆5号创官方认可实地测产高产纪录。
